Ingenuity Pathway Analysis

Bordeaux Protéome a le plaisir de vous annoncer la mise à disposition de l’outil Ingenuity Pathway Analysis (IPA) de QIAGEN.

🔍 À quoi sert IPA ?

Ingenuity Pathway Analysis (IPA) est un logiciel de bioinformatique reconnu, conçu pour l’interprétation biologique des jeux de données omiques et notamment protéomique.
Il permet notamment de :

• Visualiser et explorer les réseaux moléculaires et voies de signalisation impliqués dans vos résultats expérimentaux.
• Identifier les fonctions biologiques et processus cellulaires associées à vos jeux de données.
• Intégrer vos données expérimentales à une base de connaissances constamment mise à jour.

🧬 Quelles espèces sont prises en charge ?

IPA prend en charge l’analyse des données issues des espèces suivantes :

• Human (𝐻𝑜𝑚𝑜 𝑠𝑎𝑝𝑖𝑒𝑛𝑠),
• Mouse (𝑀𝑢𝑠 𝑚𝑢𝑠𝑐𝑢𝑙𝑢𝑠),
• Rat (𝑅𝑎𝑡𝑡𝑢𝑠 𝑛𝑜𝑟𝑣𝑒𝑔𝑖𝑐𝑢𝑠),
• Cow (𝐵𝑜𝑠 𝑡𝑎𝑢𝑟𝑢𝑠), dog (𝐶𝑎𝑛𝑖𝑠 𝑙𝑢𝑝𝑢𝑠 𝑓𝑎𝑚𝑖𝑙𝑖𝑎𝑟𝑖𝑠), horse (𝐸𝑞𝑢𝑢𝑠 𝑐𝑎𝑏𝑎𝑙𝑙𝑢𝑠), crab-eating macaque (𝑀𝑎𝑐𝑎𝑐𝑎 𝑓𝑎𝑠𝑐𝑖𝑐𝑢𝑙𝑎𝑟𝑖𝑠), rhesus macaque (𝑀𝑎𝑐𝑎𝑐𝑎 𝑚𝑢𝑙𝑎𝑡𝑡𝑎), rabbit (𝑂𝑟𝑦𝑐𝑡𝑜𝑙𝑎𝑔𝑢𝑠 𝑐𝑢𝑛𝑖𝑐𝑢𝑙𝑢𝑠), pig (𝑆𝑢𝑠 𝑠𝑐𝑟𝑜𝑓𝑎),
• Zebrafish (𝐷𝑎𝑛𝑖𝑜 𝑟𝑒𝑟𝑖𝑜),
• Chicken (𝐺𝑎𝑙𝑙𝑢𝑠 𝑔𝑎𝑙𝑙𝑢𝑠),
• Rainbow trout (𝑂𝑛𝑐𝑜𝑟ℎ𝑦𝑛𝑐ℎ𝑢𝑠 𝑚𝑦𝑘𝑖𝑠𝑠), three-spined stickleback (𝐺𝑎𝑠𝑡𝑒𝑟𝑜𝑠𝑡𝑒𝑢𝑠 𝑎𝑐𝑢𝑙𝑒𝑎𝑡𝑢𝑠),
• Fruit fly (𝐷𝑟𝑜𝑠𝑜𝑝ℎ𝑖𝑙𝑎 𝑚𝑒𝑙𝑎𝑛𝑜𝑔𝑎𝑠𝑡𝑒𝑟),
• Coundworm (𝐶𝑎𝑒𝑛𝑜𝑟ℎ𝑎𝑏𝑑𝑖𝑡𝑖𝑠 𝑒𝑙𝑒𝑔𝑎𝑛𝑠),
• Thale cress (𝐴𝑟𝑎𝑏𝑖𝑑𝑜𝑝𝑠𝑖𝑠 𝑡ℎ𝑎𝑙𝑖𝑎𝑛𝑎) and maize (𝑍𝑒𝑎 𝑚𝑎𝑦𝑠),
• Baker’s yeast (𝑆𝑎𝑐𝑐ℎ𝑎𝑟𝑜𝑚𝑦𝑐𝑒𝑠 𝑐𝑒𝑟𝑒𝑣𝑖𝑠𝑖𝑎𝑒) and fission yeast (𝑆𝑐ℎ𝑖𝑧𝑜𝑠𝑎𝑐𝑐ℎ𝑎𝑟𝑜𝑚𝑦𝑐𝑒𝑠 𝑝𝑜𝑚𝑏𝑒).

👉 L’outil est accessible à l’ensemble des utilisateurs de la plateforme Bordeaux Protéome, sur demande auprès des membres de l’équipe. N’hésitez pas à nous contacter!