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Bordeaux Proteome est une plateforme scientifique et technologique ouverte à l’ensemble des communautés scientifiques, académiques comme privées, par la mise à disposition de services, de matériels et d’expertises dans le domaine de l’analyse protéomique.

S’appuyant sur des technologies et méthodologies novatrices et sur un parc d’instruments de dernière génération, la Plateforme Bordeaux Proteome propose des prestations en analyse des protéines par spectrométrie de masse et techniques séparatives associées.

Une offre de service complète intégrant l’identification, la caractérisation et la quantification / analyse différentielle des protéines est proposée par la plateforme.

Depuis 2015, Bordeaux Proteome est certifiée ISO 9001 et NF X 50-900. Le Système de Management de la Qualité certifié concerne nos activités : recherche, développement technologique et expertise en spectrométrie de masse et protéomique dans les domaines de la biologie, de la santé et de l’agronomie.

Notre expertise

  • Identification des protéines en mélange complexe.
  • Quantification et mesure d’expression différentielle des protéines avec / sans marquage.
  • Caractérisation des modifications co/post-traductionnelles.
  • Séquençage de novo (sans comparaison à des bases de données existantes).
  • Identification des partenaires protéiques (interactomique, complexes protéiques).

Notre offre

Une plateforme

Une organisation

Plusieurs activités

Logo Life Science
Logo Heritage
Logo MS Imaging
Logo M3S

Proteomique d’expression differentielle

Identification de biomarqueurs

Interactomique

Modifications Post-Traductionnelles

Deep Proteome

Cohortes cliniques

Analyses Multi-omiques (proteines, lipides, polysaccharides)

Analyse de traces

Identification taxonomique

Sequençage de novo

Modifications des protéines

Distribution spatiale sur tissus

Multi-omique

Multi-modale

Quantification de composés exogènes par MALDI MSI

MSI data processing

Profilage de glycosylation

Complexes protéiques

Interactions protéine-protéine/ligand

Crosslink

HDX-MS

Profil d’interaction par affinité

LiP-MS (protéolyse ménagée)

Caractérisation des protéines par Top-Down MS

Nos services

Préparation des échantillonsAnalyse des protéines et des peptidesAnalyse des donnéesExpertises R&D
Pour l’analyse en spectrométrie de massePar spectrométrie de masse à haute résolutionTraitement bio-informatiqueAvec l’équipe M3S du CBMN
Séparation électrophorétique ou chhromatographique

Enrichissement ou déplétion des protéines

Enrichissement de sous-espèces peptidiques (phosphoprotéomique, glycosylation …)

Protéolyse in gel, en solution, multi-enzymatique, pour l’étude de traces
Analyses haute résolution MS et nanoLC-MS/MS (Orbitrap)

Gradients chromatographiques rapides ou résolutifs

Fragmentations CID, HCD, ETD, EThcD, UVPD
Logiciels et architecture serveur dédiés à l’identification et à la quantification des protéines

Nouveauté 2024: Chimerys, algorithme de recherche en database basé sur l’Intelligence Artificielle (IA)

Intégration de données omiques en partenariat avec le Centre de Bioinformatique de Bordeaux: validation statistique, enrichissement en termes GO, outils de visualisation et interprétation des résultats, annotation fonctionnelle des protéomes
Analyse structurale par échange isotopique ou cross-linking: étude conformationnelle, interaction cartographie d’épitopes

Imagerie MALDI des lipides, métabolites, peptides/protéines

Analyse de protéines intactes de type « Top-down »

Analyse de glycoprotéines / glycopeptides

Analyse de traces et ultra traces
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