Instruments

Spectromètres de masse

  • Orbitrap Eclipse
    Vanquish Neo + Orbitrap Eclipse (Thermo Scientific). [UVPD], [ETD], [FAIMS], [HMR], [PTCR].
    Opérationnel été 2022.
  • Orbitrap Fusion Lumos
    U3000-RSLC + Orbitrap Fusion Lumos (Thermo Scientific). [ETD].
    Opérationnel depuis 2017.
     
  • AP-SMALDI5 AF Q-Exactive
    Source AP-MALDI (TransMIT) + Q-Exactive (Thermo Scientific).
    Opérationnel depuis 2013 (Q-Exactive) et depuis 2019 (Source MALDI).
     
  • LTQ Orbitrap XL ETD
    U3000 (Dionex)/Automate HDX (LEAP) + LTQ Orbitrap XL ETD (Thermo Scientific).
    Opérationnel depuis 2009.
     
  • Q-TRAP 5500
    Nexera XR (Shimadzu) + QTRAP 5500 System (AB Sciex).
    Opérationnel depuis 2009
     
  • MALDI-TOF-TOF
    Ultraflex III TOF-TOF (Bruker Daltonics) + Détecteur Haute Masse HM4 (CovalX).
    Opérationnel depuis 2008.
  • Q-TOF Premier
    U3000-RSLC (Thermo Scientific) + Q-TOF premier (Waters Micromass).
    Opérationnel depuis 2006.
  • Q-TOF Micro
    CapLC + Q-TOF micro (Waters Micromass).
    Opérationnel depuis 2005

Bioinformatique

  • Plateformes bioinformatiques : Proteome Discoverer (Thermo Scientific).
  • Logiciels d’identification : Sequest HT (Thermo Scientific), MS Amanda (Thermo Scientific), Mascot (Matrix Science), Peaks X (Bioinformatics Solutions Inc), Prosight PD (Thermo Scientific), Chimerys (ThermoScientific).
  • Logiciels de quantification : Proteome Discoverer (Thermo Scientific).
  • Logiciels de caractérisation : Byonic (Protein Metrics).
  • Logiciels d’imagerie : MSiReader, METASPACE.

Serveurs et stockage

  • Archivage des données : 80To RAID 5.
  • 4 serveurs de calcul.
  • Hébergement dans salle serveur sous surveillance environnementale.
  • Duplication quotidienne des données vers site distant.

Biochimie des protéines

  • Systèmes d’électrophorèse 1D.
  • Systèmes d’électrophorèse 2D.
  • Systèmes d’électrophorèse liquide : OffGel (Agilent), Rotofor (Biorad), GelFree (Expedeon)
  • Analyse d’images : Scanner à fluorescence Pharos FX™ Plus avec external laser molecular imager FX (BioRad), GS-900 Densitomètre (BioRad), ImageLab (BioRad)
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