Les contaminations keratine
Afin de maximiser les chances de succès des analyses de protéines en spectrométrie de masse, il est vivement conseillé de préparer les échantillons selon les recommandations ci-dessous.
Vous : Les kératines viennent de la peau, des cheveux et des vêtements.
- Le port de la blouse et de gants propres est indispensable tout au long de la manipulation.
- Les gants doivent être renouvelés à chaque manipulation.
- Eviter le port de pulls en laine, mohair…
Le matériel : Les kératines proviennent des poussières en suspension.
- Le matériel et la vaisselle entrant en contact avec le gel doivent être lavés avec un détergent, rincés à l’eau ultrapure et séchés à l’éthanol.
- Tout le matériel doit être rangé à l’abri de la poussière.
- Dans la mesure du possible, manipuler sous une hotte à flux laminaire.
Les solutions : Les solutions elles-mêmes peuvent être source de kératines.
- Utiliser de préférence des microtubes de 1.5 ml en polypropylène transparent.
- Utiliser des produits neufs qui seront exclusivement consacrés aux gels.
- Les cones seront réservés à un usage protéomique. Porter des gants!
- Utiliser de préférence des boites de cônes pré-remplies pour éviter toute manipulation des embouts de pipette.
Le gel : Avoir un maximum de protéine dans un minimum d’acrylamide.
- Utiliser si possible des gels de faible épaisseur (0.75mm).
- Pour les gels 1D, charger les puits vides avec du tampon Laemmli pour limiter la diffusion des protéines sur les cotés lors de la migration.
- Conservation du gel dans 1% acide acétique à 4°C.
- Préférer la coloration au bleu de Coomassie à celle au nitrate d’argent.
- En cas de coloration au nitrate d’argent, traiter les échantillons au plus vite.